1387 m. Merkinėje pastatoma medinė Jogailos funduota šv. Mikalojaus bažnyčia. Praėjus septyniems metams bažnyčia sudegė. Spėjama, kad maldos namai sudegė, kai lietuviai sudegino Merkinės pilį, atitraukdami kariuomenę Vilniaus gynybai, ar, kai Merkinę sudegino kryžiuočiai. 1392 m. Jogaila įkūrė Merkinės parapiją. Istorikai mini, kad bažnyčia Merkinėje buvo pastatyta iš tvirtovės, o viena iš legendų liudija, kad ji pastatyta nauja buvusi šv. Mikalojaus parapinė bažnyčia, kuri įgavo naują titulą – Švč. Mergės Marijos dangun ėmimo. 2018 m. sausio 21 d. Kaišiadorių vyskupas Jonas Ivanauskas Merkinės Švč. Mergelės Marijos Ėmimo į dangų bažnyčiai perdavė palaimintojo Teofiliaus Matulionio relikviją. Mišių pradžioje relikvija, buvo nešama mons. dr. Algirdo Jurevičiaus, buvo pastatyta priešais altorių. Pamokslo metu vyskupas kalbėjo apie pal. Teofiliaus reikšmę Lietuvos bažnyčiai bei paragino kiekvienam atrasti vidinį dvasinį ryšį su palaimintuoju. Po šv. Mišių pal. Teofiliaus relikvija buvo pastatyta ant altoriaus. Merkinės klebonas dekanas kun. dr. Robertas Rumšas vadovavo palaimintojo Teofiliaus litanijos maldai, po kurios vyskupas palaimino relikviją ir perdavė Merkinės klebonui. Taip pat buvo perduotas ir relikvijos autentiškumą liudijantis sertifikatas. Procesijos būdu relikvija buvo nunešta ir patalpinta į Švč. Jėzaus Širdies šoninį altorių. Specialiai tam pagaminta grūdinio stiklo apsauga visuomet leis tikintiesiems iš arčiau matyti relikviją ir šauktis palaimintojo Teofiliaus užtarimo. Apeigų pabaigoje bažnyčioje vieningai nuskambėjo: „Palaimintasis Teofiliaus, melskis už mus!“.